营养基因组学正在改变功能医学的膳食干预范式。功能医学模型中，针对每位患者量身定制的营养干预是慢性病治疗和健康策略的基石。一个人的基因与营养相互作用以及肠道微生物组组成的个体差异，是治疗性膳食干预的重要组成部分。尽管营养遗传学和营养基因组学研究取得了最新进展，但同一种食物对所有人产生相同效果的观点仍然根深蒂固。研究持续表明，摄入相同食物后，餐后代谢反应（包括血甘油三酯、葡萄糖和胰岛素反应）在个体之间存在显著差异。营养遗传学研究一个人的基因谱如何影响其身体对食物的反应，影响营养素的吸收、代谢和干预效果。营养基因组学则探索食物如何影响基因表达，即营养素通过表观遗传机制对基因调控和表达产生什么影响。

一项国际临床研究揭示了膳食干预影响基因表达的分子机制。adherence to绿色地中海饮食显著提高了循环叶酸水平，叶酸的增加活跃地驱动着一碳代谢——负责甲基化过程的关键生化通路，调节基因表达并支持代谢健康。研究人员重点关注了MTHFR基因的常见变异，该变异会损害叶酸代谢。携带高风险基因型的个体通常叶酸水平较低，但高adherence to富含植物营养的饮食后，心血管风险评分反而降低了七点七四分。转录组学分析显示，这些个体的细胞发生了适应性生物重编程，替代叶酸通路基因的表达增加，补偿了遗传性酶活性降低的影响。

功能医学的临床启示在于：每位患者对营养素的反应方式独一无二，同一治疗性膳食计划在不同患者身上的效果可能截然不同，甚至同一患者在不同生命阶段的反应也可能变化。如果可能的话，所有可用的数据对于推荐个性化膳食计划都是有价值的。如果患者对某种膳食策略没有反应，或反应发生变化，治疗方案就需要相应调整。在个性化数据比以往任何时候都更加丰富的时代，功能医学从业者正在利用前沿研究，根据每位患者的特定生理特征（包括遗传、生活方式和行为改变）来评估和治疗。